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山東農(nóng)業(yè)大學(xué)揭示擬南芥pre-mRNA 剪接調(diào)控胚發(fā)育的機(jī)制(圖)
農(nóng)業(yè)網(wǎng)   時(shí)間:2019/2/19 8:45:00  來(lái)源:植物科學(xué)最前沿  閱讀數(shù):406

基因

  近日,The plant journal在線(xiàn)發(fā)表了山東農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院王秀玲團(tuán)隊(duì)與美國(guó)University of Wisconsin-Madison的Marisa S. Otegui教授合作完成的題為“AtBUD13 affects pre-mRNA splicing and is essential for embryo development in Arabidopsis”的研究論文,揭示了擬南芥剪接因子AtBUD13通過(guò)影響基因的剪接調(diào)控胚的早期發(fā)育。

  在高等植物中,胚的形態(tài)建成伴隨著一系列程序性的細(xì)胞分裂和細(xì)胞分化,該過(guò)程中受到一系列特定基因的時(shí)空表達(dá)調(diào)控。Pre-mRNA剪接是基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的重要途徑,對(duì)基因表達(dá)及蛋白合成至關(guān)重要。在真核生物中,Pre-mRNA的剪接過(guò)程主要由剪接復(fù)合體完成。剪接復(fù)合體是一個(gè)龐大的核糖核蛋白復(fù)合體,主要是由U1、U2、U4、U5、U6五個(gè)核心SnRNP以及大量的非SnRNP蛋白組成。近年來(lái),隨著結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展,酵母和人的剪接復(fù)合體的三維結(jié)構(gòu)已被解析,人們對(duì)于剪接復(fù)合體的認(rèn)識(shí)也越來(lái)越深入。但是與人和酵母中的研究相比,人們對(duì)于植物剪接體的了解還不夠深入,尤其是對(duì)其生物學(xué)功能的研究還相對(duì)較少。pre-mRNA retention and splicing complex(RES)復(fù)合體是一個(gè)非SnRNP的異源三聚體,*初在酵母中被報(bào)道,隨后在其他物種中(線(xiàn)蟲(chóng)、斑馬魚(yú)、人)也相繼被發(fā)現(xiàn)。RES復(fù)合體能通過(guò)直接與Pre-mRNA結(jié)合而介導(dǎo)某些特定基因的剪接,此外RES復(fù)合體還在剪接復(fù)合體的組裝中起作用。但是植物中是否存在RES復(fù)合體還未見(jiàn)報(bào)道。

  在酵母中,RES復(fù)合體由Bud13p、Snu17p和Pml1p三個(gè)非SnRNP亞基組成。該研究發(fā)現(xiàn)模式植物擬南芥At1G31870編碼酵母Bud13p的同源蛋白AtBud13。AtBUD13在各個(gè)發(fā)育時(shí)期的胚中高量表達(dá)。該基因功能缺失突變體的雜合體中有約25%的胚自合子時(shí)期分裂模式異常,進(jìn)而被降解導(dǎo)致種子敗育,表明純合突變體致死。RNA-seq分析顯示,AtBUD13突變導(dǎo)致了1,932不正常的剪接事件,主要表現(xiàn)為內(nèi)含子保留,尤其是長(zhǎng)度較短的內(nèi)含子(≤100堿基)。在這些剪接異常的基因中,包括52個(gè)胚早期發(fā)育關(guān)鍵基因。GO功能分析顯示AtBUD13參與調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄、DNA重組和RNA加工等核酸代謝過(guò)程。該研究*次鑒定了植物中存在RES復(fù)合體的BUD13亞基并參與胚發(fā)育的調(diào)控,該研究為進(jìn)一步鑒定植物RES復(fù)合體奠定了基礎(chǔ)。

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